然而，如果要一個一個檔案靠肉眼去比對，是否有被錯誤的修改，非常消耗時間和精神。這種時候，有一種工具可以快速地比對找出被修改的檔案。
在linux平台，有一個工具 meld ，官網在 http://meldmerge.org/
在windows平台，有一個工具是 winmerge，官網是 http://winmerge.org/
雖然CPanel提供的備分檔可以提供完整的備分，但是，遇到只要需要還原少數幾個檔案時，直接還原到上一個時間點的這種作法還是太暴力了。很多時候，我們會需要只還原被錯誤修改的檔案。
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